Les drapeaux des 16 Etats fédéraux d'Allemagne; source: istock.com/ZU_09

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L'aide régionale est destinée aux régions. C'est pourquoi en Allemagne, la mise en œuvre des programmes bénéficiant des aides des Fonds structurels a lieu à l'échelle régionale et incombe aux Länder.

Cette mise en œuvre se fait sur la base de programmes opérationnels (PO), dans lesquels est décrite la stratégie de financement de chaque région. Les PO sont élaborés conformément à la stratégie négociée au niveau national (accord de partenariat) et ils doivent être adoptés par la Commission européenne.

La Commission européenne publie des exemples de projets des Fonds régionaux et sociaux des Länder.

Les autorités chargées de la mise en œuvre des Fonds structurels européens doivent présenter un « rapport annuel sur la mise en œuvre » à la Commission européenne pour l'année civile écoulée. C'est la condition pour que celle-ci rembourse les dépenses effectuées par les bénéficiaires et préfinancées par les autorités nationales.

Les rapports annuels sur la mise en œuvre sont généralement publiés sur les sites Internet des autorités en charge de la réalisation des programmes.

En tant que ministère fédéral de tutelle et ministère de l'Europe, le BMWi gère les deux Fonds structurels que sont le FEDER et le FSE, c.-à-d. qu'il coordonne la position nationale du gouvernement fédéral et des Länder pour toutes les questions s'y rapportant, fédère les intérêts et les représente à Bruxelles auprès des organes du Conseil et de la Commission européenne en charge de la politique structurelle européenne. Le BMWi fait aussi office de bureau de coordination pour toutes les questions concernant le FEDER et il est l'interlocuteur national à la fois des Länder et de la Commission.

D'autres ministères fédéraux jouent un rôle majeur en matière de soutien structurel européen :